L'histoire implique de trois garçons. Ils étaient tous amis depuis qu'ils étaient petits. Un jour, quelque chose qui a changé toute leur vie était arrivé. Un des garçons appelé Morio, un garçon de six ans, est tombé de la balançoire quand ils jouaient. Il est resté inconscient pendant environ 12 ans dans un hôpital. Les amis et la famille de Morio ont tenté d'échapper à la tragédie et d'oublier cet accident. Les deux autres garçons, Mikihiko et Tomonari, avaient grandi et avaient presque oublié Morio. Finalement, Morio s'est réveillé et a repris conscience soudainement. Cependant, le quotient intellectuel de Morio est resté à 6 ans.

L’histoire se déroule dans un monde où les dopplegangers (Alter Ego / Doubles) existent. Nous suivons le quotidien des inspecteurs de police, Murakami & Nakabayashi. Leur enquête porte sur un criminel qui utilise des bombes. Ils découvrent, peu après l’explosion d’une école primaire, qu’un médecin de l’hôpital psychiatrique a appelé pour mettre en garde. Et c’est ainsi que commence leur association avec la patiente amnésique qu’ils surnomment, Maki. Pour une raison obscure, Maki est capable de voir et de communiquer avec les esprits qui nous entourent.